Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms