Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCND2P30279 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCND2P30279 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCND2P30279 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCND2P30279 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCND2P30279 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCND2P30279 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCND2P30279 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCND2P30279 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCND2P30279 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCND2P30279 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CCND2P30279 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCND2P30279 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCND2P30279 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND2P30279 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms