Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD247P20963 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD247P20963 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CD247P20963 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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