Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms