Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VTNP04004 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VTNP04004 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms