Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ASIC1P78348 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ASIC1P78348 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASIC1P78348 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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