Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 APOBEC3D-201ENST00000216099 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms