Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H1P32780 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H1P32780 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms