Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181 ms