Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms