Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC17Q9NP64 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms