Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms