Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms