Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLA1P09884 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms