Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms