Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms