Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms