Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms