Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms