Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms