Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTDSS1P48651 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms