Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms