Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP7AQ9Y3A4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP7AQ9Y3A4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP7AQ9Y3A4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms