Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS2Q9Y248 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms