Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH3Q9ULD8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms