Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH22Q9UJ99 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms