Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGXB4Q9UGU5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms