Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTLC3Q9NUV7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms