Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6BQ9NRW1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms