Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INCENPQ9NQS7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms