Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MEPEQ9NQ76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEPEQ9NQ76 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms