Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN28AQ9H9Z2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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