Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR12Q9C0I1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR12Q9C0I1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms