Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMBRA1Q9C0C7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms