Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUF2Q9BZD4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUF2Q9BZD4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUF2Q9BZD4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUF2Q9BZD4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NUF2Q9BZD4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUF2Q9BZD4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUF2Q9BZD4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms