Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B5Q9BWJ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms