Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms