Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3CQ9BUI4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms