Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP1Q99575 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP1Q99575 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP1Q99575 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP1Q99575 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP1Q99575 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP1Q99575 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP1Q99575 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POP1Q99575 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP1Q99575 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP1Q99575 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP1Q99575 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP1Q99575 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP1Q99575 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP1Q99575 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP1Q99575 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP1Q99575 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP1Q99575 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP1Q99575 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP1Q99575 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP1Q99575 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP1Q99575 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP1Q99575 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP1Q99575 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP1Q99575 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms