Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SORCS2Q96PQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms