Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOLD1Q96LR9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms