Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms