Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUNDC1Q96C34 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUNDC1Q96C34 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RUNDC1Q96C34 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms