Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2E3Q969T4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms