Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA10Q969M2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms