Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFD1Q92890 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms