Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC7Q8WUI4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms