Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBA3Q8TBC4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms