Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELBQ8NG08 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms