Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TC2NQ8N9U0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms